Ninja Action 2 jokoaren bigarren zatian, ninja gudari ausartak lagunduko dizkiegu beren eskumenaren buruan agindutako misioak burutzeko. Gaur egun, gure heroiak hainbat eraikinetan barneratu behar ditu. Gauaz geroztik, gazteluak eta hiriko ateak itxi egiten dira, gure pertsonaia harresiak igoko dira. Egokitzapen bereziak jantzita, gure heroia horman zehar ibiliko da. Bidean, hainbat oztopo eta tranpak egongo dira. Horiek sartu ez izateko pantailan klik egin beharko duzu eta, ondoren, gure ninja egingo exekutatu kontrako horman salto. Beraz, eraikinetan sartuko da.