Pixelmon izeneko izaki bat Minecraft munduan bizi da. Nolabait, gure heroia herrialdeko eskualde urrunenetara joan zen hemen finkatzera eta herri txiki bat eraikitzera. Pixelmon Craft jokoan lagunduko diozu horretan. Pantailan zure aurrean zure pertsonaia ikusiko duzu, kokapen jakin batean dagoena. Haren alboan, mapa txiki bat ikusiko da hainbat baliabideren kokapena adierazten duten ikonoekin. Zure heroiak leku horiek guztiak bisitatu eta baliabide horiek eskuratu beharko ditu. Ondoren, kontrol panel berezi bat erabiliz, gure heroiaren beharretarako hainbat eraikin eraikitzen hasiko zara. Tresna eta arma berriak ere sor ditzakezu.