Une compagnie de pingouins amusants a décidé d'organiser une compétition de course à pied pour déterminer lequel d'entre eux est le plus adroit et le plus rapide. Vous dans le jeu Penguin Run 3D pourrez participer à cette compétition. Avant de vous sur l'écran sera visible à la route allant au loin. Votre personnage et d'autres pingouins se tiendront sur la ligne de départ. Au signal du soleil, ils courront en avant en prenant progressivement de la vitesse. Regardez attentivement l'écran. Gérant habilement votre pingouin, vous devrez vous assurer qu'il contourne divers obstacles et, surtout, dépasse ses rivaux. Divers objets éparpillés sur la route peuvent l'y aider. En les collectant, votre personnage peut obtenir différents types de bonus bonus.