Begiratu onddoen erreinuari, larrialdi bat berriro gertatu zen. Printzesa Peach bahitu zuten. Baina oraingoan Bowser gaiztoak ez du horrekin zerikusirik, ez da harritzekoa. Gaiztoa mamu gaizto batek urrundu zuen eta gerrillarekin ihes egin zuen mundu oso ezberdineko alde ilunera, Mario bizi den tokian ez zena. Iturgintzako ausartek Minecraft munduan zeharkatu beharko dute eta bahitzailea topatuko dute. Behin atzerriko lurralde batean, Mario blokeko biztanle bezala bihurtuko da eta hori ez da harritzekoa, ez du nabarmentzeko beharrik. Laguntza heroi Super Mario MineCraft Runner lasterketan ibilbide luze batean oztopoak txanponak biltzeko.