Urrutiko mundu harrigarri batean Pokemon bezalako izakiak bizi dira. Naturaren izpirituak gurtzen dituzten taldeetan banatzen dira. Behin, Sua eta Ura izpirituen gurtzaileek errituala egin zuten eta jainkozko entitate horiek mundu honetara deitu zituzten. Baina oso izpiritu gaiztoak bihurtu ziren eta kontroletik kanpo geratu ziren. Orain planeta osoa kaosean dago eta hondamendi naturalak etengabe gertatzen dira. Pokemon Emerald bertsioan jokoan borrokatu beharko duzu. Pantailan zure pertsonaiak kokatuko diren eremu jakin bat ikusiko duzu. Suaren espiritua erasoko dute adibidez. Beren ekintzak kontrol panel dedikatu baten bidez bideratuko dituzu. Bere laguntzarekin, zure Pokémon-ek aurkariari kalte egingo dioten hainbat sorginkeria magiko aplikatzera behartuko duzu.