Ball Trek Genesis Edition jokoak Unibertsoaren jatorrian zutik jartzera gonbidatzen zaitu prozesu osoa boladun puzzle baten itxura izango du. Izan ere, bola urdinak etorkizunean eguzki-sistema osatuko duten planetak dira. Eginkizuna labirintoan bola sorta bat gidatzea da, irteera atari zurira iristeko. Mugitzen zaren bitartean pilak biltzea beharrezkoa da eta hori ezinbesteko baldintza da. Baloiak muturretan trabatu ez daitezen, hainbat komando erabili behar dituzu E, C, Q, X teklak erabiliz. Baloien kontrola alda dezakezu, aurrera zein atzera egiteko aukera emanez. Maila bakoitzean, Ball Trek Genesis Edition-n bolei lekua egiteko nonbait jarri beharreko oztopo berriak gehituko dira.
