Mushroom Kingdom-eko bizitza berriro eten da Peach printzesaren bahiketak. Bowser ezin da lasaitu eta ezin du ezer berririk asmatu printzesa bahitu ezik. Mariok Super Mario Flash-en neska bat salbatzeko bidaia egingo du, hau ez da berarentzat lehen aldia, eta abentura dibertigarri bateko parte-hartzaile izateko arrazoia duzu berriro. Gidatu Mario plataformetan zehar, perretxiko eta dortoka gaiztoen gainean salto eginez. Aurkitu iturgina Super Mario bihurtuko duen euli magiko handia. Horrez gain, plataformetan lore magiko bat aurki dezakezu, heroia indartu eta indarra emango diona Super Mario Flash-en.
