Beldurrik ez dakien komando ausart bat terroristekin borrokan sartuko da Pixel Commando jokoan. Zuzenean izuaren gorora sartu zen, non militanteen oinarriak ezkutatzen diren, bidelapur formazioak hasieran suntsitzeko. Lagundu heroiari, ausarta den arren, bakarrik borrokatu beharko du maltzurren armada baten aurka. Baina heroiak ez du gogorik galtzen, alaitasunez ibiltzen da oihanean zehar su-lerroan agertzen diren militanteei tiro eginez. Buruzagi indartsu bat zure heroiak Pixel Commando-n suntsitzen duen azkena izango da. Kontrolatu ezazu trebetasunez bizirik egon dadin eta maila bakoitzaren amaierara arrakastaz iristeko.
