Personne ne conteste les réalisations des Teenage Mutant Ninja Turtles et des Power Rangers, cependant, ils ne pouvaient pas s'entendre entre eux et chaque groupe prétend être supérieur. Pour savoir qui est le meilleur, les héros ont décidé d'organiser des combats entre eux et ils commenceront dès que vous entrerez dans le jeu Teenage Mutant Ninja Turtles VS Power Rangers : Ultimate Hero Clash. Vous choisissez les combattants qui seront les premiers à entrer dans l'arène. Après une série de batailles, un seul vainqueur devrait rester. Personne ne vous oblige à soutenir quelqu'un, vous choisissez un héros pour vous-même et vous en ferez la promotion, en aidant à vaincre tous vos rivaux dans Teenage Mutant Ninja Turtles VS Power Rangers : Ultimate Hero Clash.
