Dans un avenir lointain, les scientifiques ont appris à réduire les objets à des tailles microscopiques. Aujourd'hui, dans le jeu Spore Hunter, ils ont décidé d'envoyer le pilote dans un avion spécial pour explorer le monde micro. Votre héros devra emprunter un certain chemin et explorer ce monde. Les créatures constituées de spores attaqueront notre héros. Les numéros inscrits y seront visibles. Ils veulent dire combien de coups vous devez faire à la créature pour la détruire. Vous manœuvrant intelligemment sur votre vaisseau, vous tirez dessus avec votre arme et détruisez les spores.