Organiser Armageddon sur le champ de bataille pour votre ennemi peut être facile et simple, et même sans prendre directement part à la bataille, sans tirer ni utiliser de sorts de combat. Dans Puzzle Quest Armageddon, vous aiderez votre armée sur le terrain de jeu. Le résultat de la bataille dépendra de vos actions. Sur la droite se trouve un champ où convergeront deux armées, et sur la droite un ensemble d'icônes différentes apparaîtra, chacune signifiant certaines actions: des explosions, l'utilisation de méthodes magiques spéciales d'intimidation ou de destruction, l'introduction de nouvelles unités de combat dans la bataille: des guerriers aux compétences diverses et même des robots. Pour ce faire, vous devez trouver et réaliser rapidement des combinaisons de trois éléments identiques ou plus. Cliquez sur le champ entre les éléments que vous souhaitez échanger, ils doivent clignoter et ce n'est qu'alors qu'ils peuvent échanger des emplacements.