Dans le monde où vivent les hommes de papier, un tournoi de combat au corps à corps aura lieu aujourd'hui. Vous dans le jeu Paper Fighter 3D pourrez y participer. Après avoir choisi votre personnage, vous vous retrouverez dans l'arène pour des combats. En face de votre personnage sera un ennemi. Au signal, le duel commencera. Vous contrôlant habilement votre personnage devra se rapprocher de l'ennemi et l'attaquer. Infligeant des coups sur le corps et la tête de l'ennemi, exécutant des tours délicats, vous devrez réinitialiser le niveau de sa vie puis l'envoyer en KO. Ainsi, vous gagnerez le duel et vous recevrez un certain nombre de points pour cela.
