Les zombies ont été vaincus par les plantes plus d'une fois, mais avec la ténacité d'un âne, ils rampent toujours dans l'espoir de capturer le prochain lit de jardin. Mais maintenant, ils sont devenus plus intelligents et ont commencé à choisir des endroits où ils pensent que la défense ne sera pas si féroce et où ils pourront facilement se faufiler. Ainsi, les zombies se sont retrouvés sur le territoire du jeu Plant Girl Defense Zombie. Auparavant, les méchants avaient compris que le jardin d'enfants serait protégé par une seule fille fragile et qu'elle pourrait être facilement prise en charge. Cependant, les zombies ont cruellement mal calculé ; la fille s’est avérée difficile. Elle maîtrise différents types de magie, les éléments lui obéissent et, plus important encore, vous vous tiendrez derrière elle et aiderez à détruire les zombies par lots dans Plant Girl Defense Zombie.