Dans un monde lointain de conte de fées, aux côtés de personnes, diverses créatures fabuleuses vivent côte à côte. Dans le jeu Pregnant Fluttershy Check Up, nous allons faire connaissance avec la licorne magique, qui a besoin d'aide. Elle s'est sentie mal et a appelé une ambulance qui l'a emmenée à l'hôpital. Maintenant, vous devrez effectuer son examen, diagnostiquer et effectuer un traitement. Avant vous serez vu chambre spécialement équipée dans laquelle se trouve notre personnage. En suivant les instructions à l'écran, vous devrez effectuer des diagnostics à l'aide d'un équipement spécial. Après cela, vous prendrez les médicaments nécessaires et poserez le patient sur ses pieds.