Particle Clicker vous emmène au laboratoire de physique de l'un des instituts virtuels. Vous effectuerez des expériences dans des détecteurs de particules. En cliquant sur une grosse particule ronde et en découpant des étincelles, vous pouvez débloquer toutes les réalisations disponibles. Y compris pour obtenir un financement normal, ce qui vous permettra d'attirer des étudiants de premier cycle vers le travail, une main-d'œuvre bon marché, puis des étudiants diplômés. Ils vous laboureront dans l'espoir de défendre une thèse de doctorat. Les assistants les plus qualifiés sont des scientifiques, ils devront être dépensés.