Dans un avenir lointain, les scientifiques ont développé un navire miniature spécial à l'aide duquel il a été possible de détruire divers types de virus. Dans le jeu, Virus Hunter le contrôlera. Avant de vous sur l'écran, vous verrez le corps humain à l'intérieur duquel cette unité sera située. Il s'envolera progressivement pour gagner en vitesse. Sur son chemin, diverses bactéries apparaîtront. Vous devrez tirer avec précision à partir d'outils spéciaux pour tomber dans ces bactéries et ainsi les détruire.