Les microbes sont si petits qu'ils ne peuvent pas être vus à l'œil nu, uniquement sous un microscope à fort grossissement. Ce n'est probablement pas mal, car vous n'aimeriez probablement pas leur apparence. Dans le jeu Germ Exterminator, nous avons spécialement pour vous augmenté tous les microbes à une taille à laquelle vous pouvez facilement les voir et distinguer où ils sont mauvais, et où sont bons et utiles. Après tout, ils sont loin d'être tous pareils. Vous recevrez un blaster spécial qui tire un faisceau mortel et vous partirez pour nettoyer le corps des monstres nuisibles. Déplacez-vous dans les labyrinthes, regardez dans les fissures et tirez sur les créatures allongées vertes. Ne touchez pas les épines, elles, malgré leur apparence menaçante, sont totalement inoffensives. Trouvez et détruisez tous les microbes, vous ne pouvez pas en laisser un, sinon il se multipliera et tout deviendra encore pire.