Dans un futur lointain, des zombies sont apparus dans le monde des pixels après une série de cataclysmes et de guerres. Maintenant, des hordes de morts-vivants chassent les survivants. Dans Pixel Zombies, vous garderez l'un des établissements humains. Vous devrez détruire les hordes de zombies qui se dirigent dans sa direction. La route sera visible sur l'écran devant vous. Les zombies se déplaceront dans votre direction à différentes vitesses. Vous devrez identifier les objectifs prioritaires et commencer à cliquer dessus avec la souris. Ainsi, vous frapperez les zombies de votre choix et les détruirez. Pour chaque ennemi que vous tuez, vous recevrez un certain nombre de points.