Les batailles saisonnières commencent dans Naruto Free Fight : Saison 2. Entrent dans la bataille : Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiwa et Kakashi. Choisissez un héros que vous aiderez à vaincre vos rivaux et vous serez transféré directement à l'endroit où la bataille commencera. Plusieurs ennemis attaqueront votre personnage en même temps. Ils viendront un par un, puis en groupe. Avec l'aide des touches ZX, vous devez forcer le combattant à repousser les attaques, et il est préférable de vous attaquer et d'avancer, en collectant des bonus et en passant des niveaux. Frappez vos adversaires avec des coups de poing et des coups de pied précis. N'utilisez vos capacités spéciales que dans des cas extrêmes, lorsqu'il y aura trop d'ennemis dans Naruto Free Fight : Saison 2.