Choo Choo Charles Revenge vous emmène sur l'île d'Aranearum, où un terrible monstre se déchaîne : un hybride d'un gigapider et d'un train nommé Charles. Un archiviste, un chasseur de monstres, était autrefois capable de vaincre un monstre en le conduisant dans un tunnel et en le calfeutrant avec un bouclier de protection spécial. Mais il y a eu un échec et Charles a réussi à se libérer. Il parcourt l'île à la recherche de victimes et vous devez le retrouver. Achivarius est en vacances, vous devez vous battre sans lui et vous, contrairement au chasseur de monstres, marcherez au lieu de prendre des trains. Fouillez l'île, trouvez le monstre et détruisez-le dans Choo Choo Charles Revenge.
