Dans la deuxième partie du jeu Ninja Hands 2, vous continuerez à aider votre guerre ninja à combattre divers adversaires qui veulent le tuer. Votre combattant sera visible sur l'écran devant vous, qui se trouvera à un certain endroit. L'ennemi sera à distance de lui. Dans le coin inférieur droit, il y aura un panneau spécial avec des icônes. En cliquant dessus, vous pouvez forcer le héros à effectuer certaines actions. Vous devrez attaquer votre adversaire et utiliser vos compétences de combat pour détruire l'ennemi. Pour cela, vous recevrez des points dans le jeu Ninja Hands 2.