Un nouveau puzzle de blocs de couleurs est introduit dans Brain Bloxx. Il s'agit de deux types de figurines en bloc : rouges et jaunes. La tâche consiste à installer autant de figures de formes différentes que possible sur un petit champ carré. Dans ce cas, vous misez sur le rouge sur le jaune et vice versa. La figurine doit se tenir complètement debout ; si elle ne rentre pas, vous verrez des rayures vertes aux endroits où elle ne rentre pas, ce qui est inacceptable. Le jeu Brain Bloxx se terminera s'il n'y a plus d'endroits pour placer les pièces. Marquez un maximum de points et, pour ce faire, placez les pièces de manière rationnelle, en anticipant.