Le héros du jeu Final Ninja se considère comme le dernier ninja de son espèce. Le clan hostile a réussi à exterminer tous les proches du héros, mais celui-ci ne va pas abandonner. Même s’il doit mourir, il compte bien emmener tous ses ennemis avec lui. En attendant, vous devez trouver le repaire des ennemis et pour ce faire, vous devrez surmonter de nombreux obstacles. Utilisez les flèches pour vous déplacer, et en cliquant sur le bouton de la souris, jetez les shurikens. Si vous maintenez la touche enfoncée tout en lançant, vous pouvez vous accrocher et vous hisser sur des plates-formes plus élevées auxquelles vous ne pouvez pas accéder dans Final Ninja.