Même si le titre de Mega Mario World 2 Awakened Power met en scène le légendaire Mario, le personnage principal du jeu sera en réalité son frère Luigi. Il dut revêtir le manteau du héros, puisque Mario devait au dernier moment se rendre à la cité des crapauds, où des problèmes surgirent. Et juste au même moment, le maléfique Bowser est apparu et a commencé à menacer le Royaume Champignon. Luigi a maintenant une chance de faire ses preuves. Pendant longtemps, restant dans l'ombre de son célèbre frère, il n'a pas pu le faire. Désormais, avec votre aide, le héros à la combinaison verte pourra affronter Bowser et obtenir sa part de gloire dans Mega Mario World 2 Awakened Power.