Bear Banjo, avec sa sœur, vit dans les profondeurs de la forêt. Un jour, notre personnage s'est réveillé et a découvert que sa jeune sœur avait disparu. Maintenant, dans le jeu Banjo-Kazooie, nous l'aiderons à la trouver. Pour l'aide, notre personnage s'est tourné vers l'oiseau magique Kazue. Après un rituel magique, elle a attrapé la piste et a volé le long de celle-ci. Maintenant que vous courez le héros devra courir après elle sans tomber derrière. Soyez prudent sur la façon dont vous aurez des pièges et vous conduisez le héros devra les forcer à sauter par-dessus. Parfois, vous pouvez rencontrer différents monstres agressifs et vous devrez les détruire.