Des extraterrestres d'un monde parallèle ont envahi l'une des planètes du monde des pixels. Ils apparaissent depuis le portail situé dans les airs et commencent à former les formations de bataille. Les forces aériennes de la planète étaient alarmées. Vous dans le jeu Pixel War servira de pilote de chasse. Vous devez voler sur votre navire pour rencontrer l'ennemi et participer au combat. Manœuvrant habilement sur le navire, vous tirerez de vos canons et détruirez tous vos rivaux. Plus vous les tuez, plus vous obtenez de points.