Dans un monde lointain, vivent des créatures étonnantes toutes constituées de gelée. Vous dans le jeu Connect Jellies irez dans ce monde et les attraperez. Avant de vous sur l'écran, vous verrez le terrain de jeu sur lequel ces créatures seront situées. Ils auront une forme et une couleur différentes. Vous devrez tout examiner attentivement et trouver deux créatures de la même couleur. Vous devrez maintenant les connecter ensemble avec une ligne de souris. Ainsi, vous les retirerez du terrain de jeu et obtiendrez des points pour cette action.