Un homme primitif nommé Adam marchant dans la forêt a été attaqué par des extraterrestres. Ils ont pu endormir notre héros et le transporter jusqu'à leur bateau. Maintenant, Adam doit échapper aux extraterrestres pour retourner vers sa bien-aimée Eve. Dans Adam & Eve Aliens, vous l'aiderez dans cette aventure. Quand Adam s'est réveillé, il s'est retrouvé dans la chambre du navire. Il devra essayer de s'en sortir. Pour ce faire, vous devez ouvrir les portes. Pour que les portes s'ouvrent, votre héros aura besoin de certains objets. Pour les trouver, vous devrez fouiller complètement la pièce et résoudre certains types d'énigmes et de puzzles. Dès que vous trouvez les objets et ouvrez le passage, votre héros sera transporté au niveau suivant du jeu.