Dans un monde étonnant et lointain, des créatures telles que Pokemon vivent. Ils sont divisés en groupes qui adorent les esprits de la nature. Une fois, les adorateurs des esprits du Feu et de l'Eau ont effectué un rituel et ont convoqué ces entités divines dans ce monde. Mais ils se sont avérés être des esprits très mauvais et sont devenus incontrôlables. Maintenant, la planète entière est dans le chaos et des catastrophes naturelles se produisent constamment. Dans le jeu Pokemon Emerald Version, vous devrez les combattre. En face de vous sur l'écran, vous verrez une certaine zone dans laquelle vos personnages seront situés. Ils attaqueront par exemple l'esprit du Feu. Vous dirigerez leurs actions à l'aide d'un panneau de contrôle dédié. Avec son aide, vous forcerez votre Pokémon à appliquer divers sorts magiques avec lesquels il nuira à son adversaire.