Le héros du jeu Super Portal Maze 3D s'est retrouvé dans un labyrinthe de puzzle en trois dimensions. Il n'est pas tout à fait ordinaire. Au lieu des couloirs traditionnels qui mènent dans différentes directions, bifurquant et essayant de confondre tout le monde, vous ne verrez qu'une seule pièce et plusieurs sorties rondes de couleurs différentes. Il y a un drapeau d'arrivée dans la pièce, auquel vous devez livrer le héros et divers obstacles dangereux. La tâche consiste à atteindre le drapeau en utilisant des portails spéciaux. Ils sont généralement jumelés. C'est-à-dire qu'en entrant dans l'un, vous sortez de l'autre. Réfléchissez et choisissez la paire qui vous mènera à la fin du niveau dans Super Portal Maze 3D.
