Un groupe de cubes de différentes couleurs parcourant le monde est tombé dans un piège. Les héros se sont retrouvés dans un donjon et dans le jeu Zero Squares vous devrez les aider à en sortir. Devant vous sur l'écran, vous verrez la pièce dans laquelle votre cube sera situé. Vous pouvez utiliser les touches de contrôle pour contrôler ses actions. Quelque part dans la pièce, vous verrez un portail menant au prochain niveau du jeu. Vous devrez emmener le cube le long d'un certain itinéraire et faire en sorte qu'il pénètre dans le portail. Sur votre chemin, il peut y avoir des obstacles que votre personnage devra éviter.
