Un groupe d'extraterrestres est arrivé sur notre planète depuis les profondeurs de l'espace afin de collecter des échantillons et de voler des animaux et des personnes pour des expériences. Dans le jeu Aliens Vs Math, vous sauverez des personnes et des animaux de la captivité. Devant vous sur l'écran il y aura une clairière sur laquelle il y aura une vache. Au-dessus, un OVNI extraterrestre flottera dans les airs. Vous devrez l'abattre avec vos canons. Pour que l'arme tire, vous devrez résoudre une certaine équation mathématique qui apparaîtra devant vous à l'écran. Après vous être familiarisé avec l'équation à l'aide d'un panneau numérique spécial, vous devrez taper la réponse. S'il est donné correctement, vous tirerez le canon et abattrez l'OVNI.