Dans la deuxième partie de Ninja Dogs 2, vous continuerez à aider une escouade de chiens ninja à combattre les gardes du royaume des chats. Aujourd'hui, vous devez attaquer leurs châteaux et les capturer ou les détruire. Devant vous sur l'écran, vous verrez une certaine zone dans laquelle les bâtiments seront situés. A l'intérieur des bâtiments, vous verrez des chats soldats. Un canon sera installé à une certaine distance des bâtiments. Avec son aide, vous tirerez sur vos chiens avec vos guerres et ils, après avoir volé sur une certaine distance, s'écraseront contre le mur du bâtiment et détruiront ses chats attaquants. Pour ce faire, vous devrez calculer les trajectoires de vos tirs. Après avoir détruit tous les chats, vous recevrez des points et passerez au niveau suivant du jeu.