Deux coureurs entreront en piste dans le jeu Magic Run 3D et vous contrôlerez l'un d'eux pour l'aider à gagner, et vous à passer le niveau. Votre héros traversera seul le premier niveau, car vous devez vous mettre à l'aise et comprendre comment agir et quoi utiliser. À l'approche du prochain obstacle, cliquez sur le héros pour qu'il se transforme comme par magie et le dépasse facilement. Dans un cas, il aura besoin de force, et dans l'autre de dextérité. Escalader de hauts murs ou courir la tête en bas. Après avoir passé le niveau d'entraînement, vous serez prêt pour la compétition et ne bâillerez pas dans Magic Run 3D.
