Alors que nous nous agitons sur notre planète, réglant les relations entre pays, entre peuples et même entre voisins, des changements globaux s'opèrent dans l'espace en termes de redistribution des influences. Le jeu Alien War vous permettra d'intervenir dans le conflit entre deux races majeures et vous prendrez le parti de l'une d'entre elles, considérée comme plus développée et pacifique. Cependant, l'ennemi a aussi une armée forte, il vise la victoire et se bat depuis plus d'un siècle. Votre tâche n'est pas de laisser passer les navires ennemis en leur tirant dessus à bout portant. Comme il y en aura beaucoup, vous devez manœuvrer, changer d'altitude et de direction, afin de ne pas être sous le feu dans Alien War.