Le héros du jeu Cleaning the Islands s'est retrouvé sur une île déserte, mais il ne va pas abandonner du tout, il a des outils, des mains fortes et l'envie de faire de l'île un paradis. Mais il faut travailler dur et il faut d'abord explorer les îles voisines, qui regorgent de minéraux et de ressources. Tout d’abord, c’est du bois, puis des pierres, puis le héros fera pousser du blé, et ainsi de suite. Des aides indigènes apparaîtront et bientôt des navires marchands s'amarreront au rivage et vous aurez quelque chose à leur offrir. La vie fera rage, travaillera sans relâche et bientôt l'île sera remplie de bâtiments, et la vie en nettoyant les îles
