Par ses activités déraisonnables, l’homme a créé un déséquilibre dans le monde des virus. Si auparavant ils pouvaient coexister avec les humains, alors depuis qu'elle a appris à les combattre, les virus ont commencé à muter et à changer. Devenir plus fort et ce processus ne s'arrête pas. Avec cette approche, vous pouvez contracter un virus qu’aucun vaccin ne peut vaincre. Mais il existe une autre issue : mener une vie saine, renforcer le système immunitaire afin que les bons virus combattent les mauvais. Dans le jeu Run Healthy 2, vous aiderez l'héroïne à passer les niveaux et à devenir en meilleure santé. Pour ce faire, ramassez des pommes, des haltères, franchissez la porte verte et à la ligne d'arrivée, vous devez prendre un énorme marteau et appuyer sur Run Healthy 2.