Traditionnellement, les jeux dans le style des oiseaux Flappy sont populaires et en demande, donc de nouveaux jouets apparaissent périodiquement dans l'espace de jeu, et Flappy Ship est l'un d'eux. Il est fabriqué dans un style minimaliste. L'objet que vous contrôlerez ressemble à un avion pixelisé. Votre tâche consiste à le guider entre les obstacles sans les toucher. Vous devez le garder en sécurité le plus longtemps possible, sans le laisser heurter aucun des obstacles qui apparaissent simultanément en dessous et au-dessus de Flappy Ship.