Les scientifiques du monde entier, chacun dans leur domaine, travaillent sans relâche pour réaliser de grandes découvertes. Cependant, seuls quelques-uns réussissent ; la plupart des études restent inachevées. Leur financement est fermé faute de perspectives ou d’échecs d’expérimentations. Les héroïnes du jeu Library Mysteries sont des étudiantes d'une des universités les plus célèbres. Amelia, Candice et Ava sont passionnées par la science et souhaitent devenir célèbres. Ils ont appris que l'un des professeurs de leur institution était engagé dans un développement scientifique sérieux, mais le projet a été fermé et le professeur a disparu. Les filles aimeraient retrouver ses œuvres à la bibliothèque universitaire et les étudier. Aidez les filles dans Library Mysteries.