Le jeu Alien Quarantine se déroule sur le territoire d'un laboratoire secret où des expériences sont menées sur des créatures extraterrestres capturées. L'un des extraterrestres a réussi à se libérer, il a libéré les autres et un véritable chaos a commencé dans le laboratoire. Le héros du jeu Alien Quarantine est envoyé en reconnaissance, mais se retrouve face à un dangereux ennemi. Il doit restaurer le système de sécurité pour empêcher les monstres de pénétrer dans d'autres secteurs. Pour ce faire, vous devez activer plusieurs appareils, vous déplacer et tirer, en évitant les attaques extraterrestres.
