L'une des mégapoles a été capturée par des robots dans Mega Droid et ce n'est que le début. Il faut arrêter la rébellion le plus rapidement possible et détruire tous les robots rebelles. Un droïde de combat spécial nommé Flux a été envoyé à l'épreuve de force avec son petit assistant drone. Vous contrôlerez le robot pour qu'il écrase tous les robots qu'il rencontre dans les rues de la ville. Votre droïde effectuera les tâches assignées dans les missions et vous pourrez choisir entre trois niveaux de difficulté. Explorez chaque secteur pour débarrasser la ville entière des robots voyous dans Mega Droid