Le jeune pilote Tom a reçu l'ordre de son commandement d'infiltrer la station spatiale ennemie. Pour atterrir dessus, il devra utiliser son vaisseau spatial. Dans le jeu X-Trench Run, vous devrez aider notre héros à mener à bien ces actions. Sur votre vaisseau, vous volerez le long de la base spatiale. Sur votre chemin, vous rencontrerez divers obstacles et pièges. Lorsque vous effectuez des manœuvres dans l'espace sur votre vaisseau spatial, vous devrez éviter une collision avec ces obstacles.