Une créature nommée Pixelmon vit dans le monde de Minecraft. D'une manière ou d'une autre, notre héros s'est rendu dans les régions les plus reculées du pays pour s'installer ici et construire une petite ville. Dans le jeu Pixelmon Craft, vous l'aiderez. En face de vous sur l'écran, vous verrez votre personnage, qui se trouve à un certain endroit. Sur le côté de celui-ci, une petite carte sera visible avec des icônes indiquant l'emplacement de diverses ressources. Votre héros devra visiter tous ces endroits et obtenir ces ressources. Ensuite, à l'aide d'un panneau de contrôle spécial, vous commencerez la construction de divers bâtiments pour les besoins de notre héros. Vous pouvez également créer de nouveaux outils et armes.