La base scientifique des terriens située sur Mars a été attaquée par une race extraterrestre inconnue. Dans Hyperspace Marine Squad: Attack of the Biobugs, vous serez envoyé pour les combattre au sein d'une escouade des forces spéciales. Après avoir atterri près de la base extraterrestre, vous vous dirigerez dans sa direction. Regardez autour de vous attentivement. L'ennemi peut vous attaquer à tout moment. En gardant vos distances, vous devrez l'attraper à la vue de votre arme et ouvrir le feu. En tirant avec précision, vous détruirez les biobugs. Après leur mort, des objets peuvent tomber d'eux. Vous devrez récupérer ces trophées. Ils peuvent grandement améliorer votre héros.