Le héros du jeu Counter-Strike : Reboot participera, avec votre aide, à douze missions. Le contenu étant strictement secret, les objectifs seront révélés au fur et à mesure que vous accomplirez la mission précédente. Le premier s'appelle Alpha et votre tâche est de repousser l'attaque des terroristes qui veulent capturer votre base. Dans d'autres missions, vous devrez effectuer d'autres tâches, telles que : libérer des otages, détruire des bases terroristes, déminer, etc. Toutes les missions sont limitées dans le temps, vous devez résoudre les problèmes rapidement et efficacement dans Counter-Strike : Reboot.
