Tout type d'activité requiert du professionnalisme, mais dans certaines professions il est également nécessaire de respecter certains aspects moraux, et cela s'applique notamment aux divers développements scientifiques qui peuvent nuire aux personnes. Le héros du jeu Secret Lab Chronicles, le professeur Benjamin, a reçu une offre alléchante de travailler dans un laboratoire privé sur des expériences secrètes. Il a décidé d'accepter, mais lorsqu'il a commencé à travailler, il s'est rendu compte que si les expériences réussissaient, l'humanité serait confrontée à une autre menace d'émergence d'une arme qui ne pourrait être comparée à aucune des armes existantes. Le héros veut dénoncer tous ceux qui sont derrière la création et le fonctionnement du laboratoire, mais il a besoin de preuves et vous devez les collecter dans Secret Lab Chronicles.