Dans l'ancien Japon, il y avait un Ordre de Ninja Warriors qui combattait divers ennemis de l'état et des monstres. Aujourd'hui, nous sommes dans le jeu Ninja Defender, nous aiderons une guerre à entrer dans le temple et remplir la tâche de la tête de son ordre. Notre héros voyageant à travers le temple pénètrera dans ses salles. Il sera attaqué par divers monstres. Notre personnage utilisera des armes comme un boomerang. En l'envoyant dans l'ennemi, nous le frapperons, puis l'objet reviendra. Nous devrons déplacer le personnage pour qu'il le repousse et fasse de nouveau le lancer. Si nous n'avons pas le temps de le faire, nous perdrons l'arme et perdrons le round.