Sur l'une des îles de l'océan Pacifique, une base gouvernementale secrète était située où des scientifiques ont mené des expériences sur des humains. Mais voici le problème, les sujets de test se sont libérés et ont détruit la plupart du personnel de la base. Certains des scientifiques ont tous réussi à s'échapper et se sont enfermés dans la cantine de la base. Dans le jeu Cry Islands, vous devrez entrer sur l'île et détruire tous les mutants. Votre héros sera déposé en hélicoptère dans une certaine partie de l'île. Avec les armes à portée de main, vous devrez avancer et regarder attentivement autour de vous. Dès que vous remarquerez l'ennemi, vous devrez viser votre arme sur l'ennemi et ouvrir le feu pour tuer. Tirant avec précision sur l'ennemi, vous le détruirez. Pour chaque kill, vous recevrez un certain nombre de points.