Dans la deuxième partie du jeu Pandemic 2, vous poursuivrez votre mission de détruire toute l'humanité sous la forme d'une pandémie mortelle. Le jeu commence par le choix du type de maladie : virus, bactérie ou parasite. Vous choisirez alors un point de départ de votre infection. De là, vous devrez propager votre maladie au reste du monde. En vous propageant dans le monde entier, vous pouvez améliorer votre maladie et faire en sorte que personne n’en souffre. Modifiez constamment votre virus afin que l’humanité ne puisse pas trouver de remède. Alors petit à petit vous détruirez toute la population de la planète dans le jeu Pandemic 2