En tant que membre d'une escouade des forces spéciales, vous effectuerez des missions secrètes à travers le monde dans Secret Oparetion. Au début du jeu, vous devrez choisir votre personnage. Ramassez ensuite des armes, des explosifs et des munitions pour lui. Dès que vous faites cela, votre héros sera dans un certain endroit. A l'aide des touches de contrôle, vous dirigerez ses actions. Vous devrez avancer à l'aide du radar. Dès que vous remarquez l'ennemi, attaquez-le. En tirant avec précision et en utilisant des grenades, vous détruirez les soldats ennemis et obtiendrez des points pour cela. Après la mort de l'ennemi, n'oubliez pas de récupérer les trophées lâchés par lui.